Der Große Labussee liegt in der Mecklenburgischen Seenplatte im Müritz-Nationalpark etwa zehn Kilometer südwestlich von Neustrelitz zwischen den Dörfern Zwenzow und Klein Quassow. Er gehört zur sogenannten sonstigen Binnenwasserstraße des Bundes Quassower Havel, die rechtlich zur Oberen Havel-Wasserstraße zählt. Zuständig ist das Wasserstraßen- und Schifffahrtsamt Oder-Havel.